К недостаткам цеолитов как адсорбентов для газовой хроматографии относят их высокую влагоемкость (поэтому молекулярные сита являются очень хорошими осушителями) и способность взаимодействовать с кислотами и алюминием, в связи с чем нельзя применять для изготовления колонок алюминиевые трубки.

При температуре выше 650 °С изменяется структура и резко ухудшаются адсорбционные свойства цеолитов. Поэтому перед использованием рекомендуется прокаливать цеолит 5А 2 ч при 150—350 °С в вакууме или продувать водородом при 60 °С в течение трех суток. Согласно другим данным, цеолит 5А целесообразно активировать 2 ч при 400 °С с последующим охлаждением в эксикаторе или токе сухого водорода и выдерживать при 400—650 °С. Сорбционные свойства цеолитов регенерируют аналогичным образом.

Одна из особенностей цеолитов состоит в том, что вещества, размеры молекул которых близки к размерам пор, могут адсорбироваться практически необратимо. Так, широко используют способность молекулярного типа 5А поглощать углеводороды нормального строения. Соответствующие методы в газовой хроматографии получили название «методик удаления».

Неорганические соли используют либо в виде кристаллических частиц, либо в виде слоя, нанесенного из раствора на инертный носитель. Имеются данные о применении нитрида бора, сульфида молибдена, а также хлоридов и сульфатов различных металлов.

Пористые полимеры впервые были введены в хроматографическую практику Холлисом. Эти адсорбенты, получаемые путем полимеризации мономеров с различными функциональными группами, обладают однородной пористостью, регулируемыми сорбционными характеристиками и термической устойчивостью до 200—300 °С. Наиболее распространенными полимерными адсорбентами являются порапаки Q, P, R, S, T, N, хромосорбы 101—108 и отечественный полисорб. Порапак Q, хромосорб 101, 102 и полисорб-1 являются неполярными адсорбентами, полученными на основе дивинилдибензола и стирола. Другие пористые полимеры содержат различные функциональные группы и обеспечивают полярные взаимодействия с сорбатами. Неполярные пористые полимеры очень эффективны для анализа полярных газов.