В химической отрасли водород главным образом используется для синтеза метанола и аммиака. Остальная доля водорода приходящаяся на эту отрасль, используется в прочих химических производствах: например, синтез углеводородов - получение моторного топлива (бензина, дизельного топлива и т.д.) и ряда ценных индивидуальных органических соединений, оксосинтез - оксидирование алкенов синтез-газом с последующим гидрированием полученных альдегидов в соответствующий спирт, гидрирование жиров - процесс насыщения водородом непредельных кислот с получением твердых жировых продуктов, которые используются в пищевой промышленности.

В процессах современной нефтепереработки водород используется в следующих процессах:

- гидроочистка от серы, кислорода и азота;

- стабилизация нефтепродуктов путем гидрирования олефинов;

- гидрогенизация ароматических углеводородов в нафтеновые;

- процесс гидроалкилирования алкилзамещенных ароматических углеводородов;

- в процессах гидрокрекинга.

Водород широко используется в металлургии как энергоноситель и восстановитель.