Мембранные белки (на примере БР)Статьи / Полупрепаративный микробиологический синтез биологически активных соединений, меченных стабильными изотопами водорода и углерода / Мембранные белки (на примере БР)Страница 1
2
Н-меченый БР.
Пространственная расположение БР в билипидной мембране и роль ароматических аминокислот в мембранном взаимодействии показаны на рис 4. Для изучения включения 2H-меченых ароматических аминокислот использовали метод масс-спектрометрии ЭУ после модификации смеси свободных аминокислот белкового гидролизата в метиловые эфиры N-Днс-производных аминокислот. Чтобы получить воспроизводимый результат по включению 2Н-меченых ароматических аминокислот, сначала снимали полный скан масс-спектр ЭУ смеси метиловых эфиров N-Днс-производных 2Н-меченых аминокислот. Затем проводили разделение метиловых эфиров N-Днс-производных ароматических аминокислот методом обращенно-фазовой ВЭЖХ и получали масс-спектры ЭУ для каждой индивидуальной аминокислоты. 2Н-меченые ароматические аминокислоты, занимающие шкалу массовых чисел от 414 до 456 представляли собой смеси молекул с различным количеством включенных атомов дейтерия; для фенилаланина пик молекулярного иона соответствовал [М]+.
,14%
при m/z 417 (вместо [М]+.
при m/z 412 для немеченого фенилаланина (пики немеченых аминокислот не показаны)), тирозина - [М]+.
,
15%
при m/z 429 (вместо [М]+.
при m/z 428), триптофана - [М]+.
,
11%
при m/z 456 (вместо [М]+.
при m/z 451) (рис. 17). Уровень дейтерированности, соответствующий увеличению молекулярной массы составил для тирозина - один, фенилаланина и триптофана - пять атомов дейтерия. Так как данные по уровню дейтерированности фенилаланина, тирозина и триптофана совпадают с уровнем дейтерированности исходных аминокислот, можно сделать вывод о достаточно высокой эффективности включения 2H-меченых ароматических аминокислот в молекулу белка. Таким образом, включение 2Н-меченых аминокислот в молекулу БР обладало специфичным характером; дейтерий детектировался во всех остатках ароматических аминокислот. Однако здесь необходимо подчеркнуть, что присутствие пиков [M]+. протонированных и полудейтерированных аналогов фенилаланина с [M]+. при m/z 414, 15%; 415, 20% и 416, 11%, тирозина с [M]+. при m/z 428, 12% и триптофана с [M]+. 455 и 457, 9% с различным вкладом в уровни дейтерированности молекул, свидетельстствует о сохранении небольшой доли минорных путей их биосинтеза de novo, приводящим к разбавлению дейтериевой метки и, по-видимому, определяется самими условиями биосинтетического включения 2Н-меченных ароматических аминокислот в молекулу белка.
Для разделения 2Н-меченых аминокислот использовали метод обращенно-фазовой ВЭЖХ на октадецилсилановом селикагеле силасорбе С18, эффективность которого была подтверждена разделением метиловых эфиров N-Днс-производных 2Н-меченых аминокислот из других микробных объектов, как метилотрофные бактерии и микроводоросли (Егорова, 1993). Этот метод был адаптирован к условиям хроматографического разделения смеси метиловых эфиров N-Днс-производных аминокислот гидролизата БР, заключающийся в оптимизации соотношения элюентов, форме градиента и скорости элюции с колонки. Наилучшее разделение достигалось при градиентной элюции смесью растворителей ацетонитрил : трифторуксусная кислота, (100 : 0.1 - 0.5 об/об), при этом удалось разделить триптофан и трудно разрешимую пару фенилаланин/тирозин. Степени хроматографической чистоты выделенных метиловых эфиров N-Днс-[2, 3, 4, 5, 6- 2H5]фенилаланина, N-Днс-[3, 5- 2H2]тирозина и N-Днс-[2, 4, 5, 6, 7- 2H5]триптофана составили 97, 96 и 98% соответственно, а выхода 87-95%. Еще раз полученный результат подтвердил масс-спектрометрический анализ выделенного обращенно-фазовой ВЭЖХ метилового эфира N-Днс-[2, 3, 4, 5, 6- 2H5]фенилаланина (рис 18, сканирование при m/z 70-600, базовый пик m/z 170, 100%). Доказательством наличия дейтерия в фенилаланине является пик тяжелого молекулярного иона метилового эфира N-Днс-фенилаланина ([М]+.
Смотрите также
Композиционные триботехнические материалы на основе олигомеров сшивающихся смол
...
Технеций
Технеций
Технеций (лат. Technetium), Тс,
радиоактивный химический элемент VII группы периодической системы Менделеева,
атомный номер 43, атомная масса 98, 9062; металл, ковкий и пласт ...
Торий (Thorium), Th
Впервые торий выделен Й. Берцелиусом в 1828 году из минерала, позже получившего название торит (содержит сульфат тория).
Торий был назван его первооткрывателем по имени бога грома Тора в скандинавской ...